Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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