Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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