Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Obox3Q3UT54 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.2 ms