Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm43110-201ENSMUST00000198877 226 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Fuom-202ENSMUST00000120034 680 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 AC154548.2-201ENSMUST00000224621 469 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
DmdP11531 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cdrt4os1-202ENSMUST00000153180 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DmdP11531 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DmdP11531 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DmdP11531 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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