Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6880A3KG45 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6880A3KG45 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms