Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ChfrQ810L3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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ChfrQ810L3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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ChfrQ810L3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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ChfrQ810L3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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ChfrQ810L3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ChfrQ810L3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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