Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pde1bQ01065 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pde1bQ01065 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pde1bQ01065 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms