Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VdrP48281 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VdrP48281 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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VdrP48281 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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