Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
P18528 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
P18528 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
P18528 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms