Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ift46Q9DB07 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms