Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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