Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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