Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin2bQ01097 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms