Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Trav4-1-201ENSMUST00000199078 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Mgst2-201ENSMUST00000099106 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm11307-201ENSMUST00000121088 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprmP28828 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm14323-201ENSMUST00000122418 627 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 AC113282.4-201ENSMUST00000225273 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Tpm1-203ENSMUST00000050905 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Defa21-201ENSMUST00000076754 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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