Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms