Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms