Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Pramef8Q8CE24 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Pramef8Q8CE24 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Pramef8Q8CE24 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms