Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms