Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Thbs2Q03350 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms