Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TtrP07309 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TtrP07309 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms