Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm14323-201ENSMUST00000122418 627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NhsB1AV60 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm8955-201ENSMUST00000182945 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Gm33024-201ENSMUST00000203143 633 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NhsB1AV60 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms