Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cdca8Q8BHX3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms