Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Emx2Q04744 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms