Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms