Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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