Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp4P35123 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms