Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms