Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hdac6Q9Z2V5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac6Q9Z2V5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac6Q9Z2V5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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