Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrknQ9WVS6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms