Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Extl3Q9WVL6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Extl3Q9WVL6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Extl3Q9WVL6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Extl3Q9WVL6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Extl3Q9WVL6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Extl3Q9WVL6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms