Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp1a4Q9WV27 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a4Q9WV27 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms