Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms