Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vav3Q9R0C8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vav3Q9R0C8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vav3Q9R0C8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms