Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd4Q9QY39 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd4Q9QY39 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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