Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChmQ9QXG2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChmQ9QXG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms