Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sall2Q9QX96 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sall2Q9QX96 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall2Q9QX96 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall2Q9QX96 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms