Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chaf1aQ9QWF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chaf1aQ9QWF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms