Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabgef1Q9JM13 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rabgef1Q9JM13 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rabgef1Q9JM13 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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