Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pole3Q9JKP7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pole3Q9JKP7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pole3Q9JKP7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pole3Q9JKP7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pole3Q9JKP7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pole3Q9JKP7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pole3Q9JKP7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pole3Q9JKP7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms