Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl39Q9JKF7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl39Q9JKF7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms