Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnq4Q9JK97 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnq4Q9JK97 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnq4Q9JK97 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms