Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pus3Q9JI38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pus3Q9JI38 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pus3Q9JI38 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms