Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtaQ9JHK4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RabggtaQ9JHK4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtaQ9JHK4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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