Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM12Q9H4Q4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM12Q9H4Q4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM12Q9H4Q4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms