Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chst1Q9EQC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chst1Q9EQC0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chst1Q9EQC0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chst1Q9EQC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chst1Q9EQC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chst1Q9EQC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chst1Q9EQC0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chst1Q9EQC0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chst1Q9EQC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms