Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
V1ra8Q9EQ48 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms