Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r53Q9EP93 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms