Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aph1cQ9DCZ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aph1cQ9DCZ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms