Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan4Q9DCK3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tspan4Q9DCK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms