Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm2aQ9DAR1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm2aQ9DAR1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms